Налоговый период, в котором завершены НИОКР (отдельные этапы работ), может не совпадать с налоговым периодом, в котором налогоплательщик получает исключительные права на результаты интеллектуальной деятельности и принимает решение о выборе порядка учета понесенных расходов.
В этом случае отчёт о выполненных НИОКР (отдельных этапах работ), расходы на которые признаются в размере фактических затрат с применением коэффициента 1,5, налогоплательщик вправе представить в налоговый орган одновременно с налоговой декларацией по итогам налогового периода, в котором в налоговом учете формируется первоначальная стоимость нематериального актива, либо расходы начинают учитываться в составе прочих расходов в течение установленного срока (двух лет).
Такие разъяснения содержатся в письме Министерства финансов Российской Федерации от 23.03.2015 №03-03-10/15777. Данные разъяснения доведены ФНС России до нижестоящих налоговых органов для использования в работе письмом от 20.05.2015 №ГД-4-3/8484@.